提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
2023年“欢乐春节”庆典音乐会柏林举办******
中新社柏林1月16日电 2023年“欢乐春节”庆典音乐会暨《民族盛装》图片展开幕式16日晚在柏林中国文化中心(下称“中心”)举办。活动共吸引了150多位中德嘉宾出席,多位旅德知名中国音乐家和德国音乐家为来宾奉上了一场中西合璧的视听文化盛宴。
中国驻德国大使馆公使曾颖如在致辞中表示,春节是中国最为重要的传统佳节,也日益受到世界各地人们的喜爱。多年来,德国各地春节庆祝活动丰富多彩,“欢乐春节”文化品牌更是为德国民众所熟知和认可,成为传播中华文化、让德国了解中国的重要窗口和载体。随着新冠疫情日益放缓,中国及时调整了疫情防控政策,并颁布实施了中外人员往来便利化举措,相信在新的一年里中德文化和旅游等各领域交流将迎来不断前行的蓬勃动力。
柏林中国文化中心主任孙勤航表示,每年中心都会举办欢庆春节的活动,深受柏林民众欢迎。今年中心将推出以“欢乐春节”为主题的线上和线下系列庆祝活动,包括音乐会、展览、电影、文化沙龙、视频图片展播以及春节文化体验等形式和内容。今年中心也将迎来成立15周年庆典,中心将继续致力于向德国公众全面介绍中国的发展状况和成就,促进中德两国在各领域的交流与合作,增进两国人民之间的相互了解和友谊。
音乐会开场曲目《即兴曲》和《晋调》由中德艺术家合作演奏,音乐会演奏作品既有《浏阳河》《大浪淘沙》《红梅赞》《春江花月夜》《彝族舞曲》《雨莲花开》等中国观众耳熟能详的传统曲目,也有勃拉姆斯《匈牙利舞曲》《圆号三重奏》、贝多芬《春天奏鸣曲》《加森豪尔三重奏》等西方经典曲目,体现出中欧文明的交流互鉴。
来宾们纷纷表示,这是一场令人难忘的精彩演出,是对新年最美好的祝福。
当晚,《民族盛装》图片展同时开幕,该展通过多彩绚丽的民族盛装,为观众呈现中华民族历史变迁、经济发展、文化演进的壮阔画卷,展示中国各民族团结一心、各美其美的和谐景象。(完)